Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrbp1Q99PL5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms