Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim8Q99PJ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms