Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem2Q99NH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem2Q99NH8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms