Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc26a5Q99NH7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc26a5Q99NH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms