Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NsmfQ99NF2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NsmfQ99NF2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms