Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Bco2Q99NF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Bco2Q99NF1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bco2Q99NF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bco2Q99NF1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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