Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms