Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl1Q99N96 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms