Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tdrd1Q99MV1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.2 ms