Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b4Q99ME6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms