Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprtQ99M80 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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