Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdca3Q99M54 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca3Q99M54 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms