Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdpd3Q99LY2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms