Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms