Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp5lQ99LH9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp5lQ99LH9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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