Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnpo2Q99LG2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms