Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms