Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Me2Q99KE1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms