Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1bQ99JY6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Higd1bQ99JY6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms