Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spef1Q99JL1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms