Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ddb2Q99J79 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ddb2Q99J79 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ddb2Q99J79 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ddb2Q99J79 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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