Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc8b1Q925Q3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc8b1Q925Q3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms