Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtpbp3Q923K4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtpbp3Q923K4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms