Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim59Q922Y2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim59Q922Y2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms