Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TardbpQ921F2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TardbpQ921F2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms