Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smarca5Q91ZW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms