Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc5a4bQ91ZP4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc5a4bQ91ZP4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms