Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atpaf2Q91YY4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atpaf2Q91YY4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms