Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp1bQ91YK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1bQ91YK2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms