Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg13Q91YI1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg13Q91YI1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms