Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm2Q91YD4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms