Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csde1Q91W50 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csde1Q91W50 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms