Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp3Q91W36 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms