Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Odf4Q8VI88 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf4Q8VI88 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms