Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thoc3Q8VE80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms