Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Fyco1Q8VDC1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fyco1Q8VDC1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms