Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd1Q8VCZ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpusd1Q8VCZ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms