Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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