Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn4Q8VCH8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn4Q8VCH8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms