Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh10Q8VCH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rdh10Q8VCH7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdh10Q8VCH7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh10Q8VCH7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdh10Q8VCH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms