Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2W9

Pank3, Pantothenate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank3Q8R2W9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pank3Q8R2W9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pank3Q8R2W9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms