Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg10Q8R1P4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg10Q8R1P4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms