Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CipcQ8R0W1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CipcQ8R0W1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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