Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga1Q8R0H9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gga1Q8R0H9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms