Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms