Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc5Q8K4Z2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms