Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hecw1Q8K4P8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms