Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casc3Q8K3W3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casc3Q8K3W3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms