Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms