Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f2Q8K3M1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms